MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	TAT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
2	NC_018656	TGA	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463878
3	NC_018656	TCT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
4	NC_018656	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
5	NC_018656	T	6	6	3232	3237	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
6	NC_018656	T	7	7	3251	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
7	NC_018656	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
8	NC_018656	T	7	7	3453	3459	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
9	NC_018656	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
10	NC_018656	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463878
11	NC_018656	CAA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
12	NC_018656	AAC	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
13	NC_018656	CTT	2	6	3694	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
14	NC_018656	ATTTC	2	10	3861	3870	20 %	60 %	0 %	20 %	407463878
15	NC_018656	ATTG	2	8	3951	3958	25 %	50 %	25 %	0 %	407463878
16	NC_018656	CTT	4	12	3982	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
17	NC_018656	CAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
18	NC_018656	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
19	NC_018656	TAT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
20	NC_018656	ATTT	2	8	4321	4328	25 %	75 %	0 %	0 %	407463878
21	NC_018656	T	6	6	4326	4331	0 %	100 %	0 %	0 %	407463878
22	NC_018656	ATC	3	9	4527	4535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
23	NC_018656	T	7	7	4562	4568	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
24	NC_018656	AAC	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
25	NC_018656	TC	3	6	4604	4609	0 %	50 %	0 %	50 %	407463879
26	NC_018656	TCC	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463879
27	NC_018656	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
28	NC_018656	GAA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463879
29	NC_018656	TCT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463879
30	NC_018656	CAA	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
31	NC_018656	T	6	6	4810	4815	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
32	NC_018656	GTT	2	6	4826	4831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463879
33	NC_018656	T	7	7	4873	4879	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
34	NC_018656	TAA	2	6	4896	4901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463879
35	NC_018656	CAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
36	NC_018656	T	6	6	4915	4920	0 %	100 %	0 %	0 %	407463879
37	NC_018656	TCA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
38	NC_018656	TCA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
39	NC_018656	CAT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
40	NC_018656	TTTGA	2	10	5161	5170	20 %	60 %	20 %	0 %	407463879
41	NC_018656	TCTT	2	8	5182	5189	0 %	75 %	0 %	25 %	407463879
42	NC_018656	GACAT	2	10	5301	5310	40 %	20 %	20 %	20 %	407463879
43	NC_018656	GCA	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463880
44	NC_018656	ATCTG	2	10	5584	5593	20 %	40 %	20 %	20 %	407463880
45	NC_018656	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463880
46	NC_018656	T	6	6	5637	5642	0 %	100 %	0 %	0 %	407463880
47	NC_018656	AT	3	6	5757	5762	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
48	NC_018656	A	6	6	5773	5778	100 %	0 %	0 %	0 %	407463880
49	NC_018656	TGA	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
50	NC_018656	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	407463880
51	NC_018656	TGA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
52	NC_018656	AATC	2	8	5908	5915	50 %	25 %	0 %	25 %	407463880
53	NC_018656	AAGAA	2	10	5971	5980	80 %	0 %	20 %	0 %	407463880
54	NC_018656	TACA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	0 %	25 %	407463880
55	NC_018656	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
56	NC_018656	AAAC	2	8	6055	6062	75 %	0 %	0 %	25 %	407463880
57	NC_018656	A	7	7	6076	6082	100 %	0 %	0 %	0 %	407463880
58	NC_018656	AT	3	6	6089	6094	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
59	NC_018656	AAC	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
60	NC_018656	CCA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463880
61	NC_018656	CAA	2	6	6224	6229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
62	NC_018656	ATT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
63	NC_018656	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463880
64	NC_018656	ATA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463880
65	NC_018656	TAAT	2	8	6396	6403	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
66	NC_018656	GGAA	2	8	6416	6423	50 %	0 %	50 %	0 %	407463880
67	NC_018656	A	6	6	6425	6430	100 %	0 %	0 %	0 %	407463880
68	NC_018656	A	6	6	6472	6477	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
69	NC_018656	ATCAA	2	10	6497	6506	60 %	20 %	0 %	20 %	407463881
70	NC_018656	AATTC	2	10	6548	6557	40 %	40 %	0 %	20 %	407463881
71	NC_018656	GAT	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
72	NC_018656	ATGA	2	8	6676	6683	50 %	25 %	25 %	0 %	407463881
73	NC_018656	AATG	2	8	6775	6782	50 %	25 %	25 %	0 %	407463881
74	NC_018656	A	6	6	6795	6800	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
75	NC_018656	TCC	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463881
76	NC_018656	CTA	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463881
77	NC_018656	A	8	8	6839	6846	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
78	NC_018656	TAAA	2	8	6929	6936	75 %	25 %	0 %	0 %	407463881
79	NC_018656	A	6	6	7004	7009	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
80	NC_018656	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463881
81	NC_018656	ATT	2	6	7107	7112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463881
82	NC_018656	TGA	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
83	NC_018656	TCAAAA	2	12	7168	7179	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407463881
84	NC_018656	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463881
85	NC_018656	CTT	2	6	7220	7225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463881
86	NC_018656	A	6	6	7229	7234	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
87	NC_018656	TGA	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
88	NC_018656	TGA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
89	NC_018656	A	6	6	7455	7460	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
90	NC_018656	A	6	6	7487	7492	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
91	NC_018656	GCA	2	6	7510	7515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463881
92	NC_018656	A	6	6	7531	7536	100 %	0 %	0 %	0 %	407463881
93	NC_018656	CTAG	2	8	7537	7544	25 %	25 %	25 %	25 %	407463881
94	NC_018656	CAAG	2	8	7622	7629	50 %	0 %	25 %	25 %	407463882
95	NC_018656	CCT	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463882
96	NC_018656	TTG	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
97	NC_018656	ATT	2	6	7677	7682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
98	NC_018656	CT	3	6	7768	7773	0 %	50 %	0 %	50 %	407463882
99	NC_018656	AC	3	6	7777	7782	50 %	0 %	0 %	50 %	407463882
100	NC_018656	AAT	2	6	7793	7798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
101	NC_018656	GCA	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
102	NC_018656	TCT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
103	NC_018656	GGT	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463882
104	NC_018656	GGA	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
105	NC_018656	CAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
106	NC_018656	ATC	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463882
107	NC_018656	CTT	2	6	7986	7991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
108	NC_018656	CTTT	2	8	7999	8006	0 %	75 %	0 %	25 %	407463882
109	NC_018656	GCA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
110	NC_018656	GTT	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
111	NC_018656	CGT	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463882
112	NC_018656	CCA	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463882
113	NC_018656	GCA	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
114	NC_018656	AAT	2	6	8231	8236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
115	NC_018656	AAT	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
116	NC_018656	AATT	2	8	8345	8352	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
117	NC_018656	T	6	6	8355	8360	0 %	100 %	0 %	0 %	407463882
118	NC_018656	AAT	2	6	8438	8443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
119	NC_018656	TTG	2	6	8512	8517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
120	NC_018656	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
121	NC_018656	CAA	2	6	8607	8612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
122	NC_018656	ATG	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
123	NC_018656	ATG	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
124	NC_018656	ATA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
125	NC_018656	AGC	2	6	8762	8767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
126	NC_018656	TTC	2	6	8830	8835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
127	NC_018656	TTC	2	6	9000	9005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
128	NC_018656	ATT	2	6	9038	9043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
129	NC_018656	GGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
130	NC_018656	CCA	3	9	9138	9146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463882
131	NC_018656	TTTG	2	8	9266	9273	0 %	75 %	25 %	0 %	407463882
132	NC_018656	ATTA	2	8	9332	9339	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
133	NC_018656	ATT	2	6	9437	9442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
134	NC_018656	GAT	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
135	NC_018656	AGA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
136	NC_018656	TAT	2	6	9654	9659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
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262	NC_018656	TTC	2	6	15381	15386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463890
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